O InovaJuntos é executado pela Confederação Nacional de Municípios (CNM), em parceria com o Centro de Estudos Sociais da Universidade de Coimbra e o cofinanciamento da União Europeia. O projeto realiza missões e intercâmbios
entre técnicos brasileiros, portugueses e latino-americanos.

O objetivo das missões e intercâmbios é a troca de experiências e soluções inovadoras por meio da cooperação triangular.

A primeira missão será realizada entre municípios brasileiros e portugueses, nos dias 21 a 29 de maio, em Brasília e nos Municípios brasileiros sede dos clusters temáticos do Projeto.